当时日本人在星洲有很多铁矿山，从这里开采的优质铁矿满足了日本国内25%的供应，而日本国内生产的武器弹药则是运到中国大陆来屠杀中国人的。从1938年起，马来亚新加坡华人开始对日货的抵制和发动日本人矿山企业的大罢工，动员日本企业的工人退职，让日本人企业开不了工，林谋盛是这次运动的策划人之一。位于丁加奴州的龙运铁矿是日本人的企业，雇用华工近3000人，是日本人开办规模最大的铁矿，生产大量的铁矿石运往日本制造军火。林谋盛考虑，如果能够发动龙运铁矿华工罢工，将给日本侵略者以沉重的打击。而日本人也早有准备，在矿山上设立武装警备队，严防外来人进来宣传鼓动。林谋盛等人冒着生命危险深入矿区，成功地策动了来自中国内地河南、山东、温州、福州等地的三千名矿工停工离开矿山，甚至一大批人因此而乘船返回了中国。龙运铁矿华工集体罢工后，逼使铁矿陷于瘫痪，日本军火工厂也被迫停产。这一罢工事件不仅震动星马地区，而且轰动了世界，当时的各国通讯社纷纷发出电讯报导。

1941年12月，日寇进攻马来亚半岛，林谋盛出任新加坡华侨抗敌动员总会执委兼劳工部部长。随着日军的步步逼近，新加坡城内一片恐慌。由于陈嘉庚先生已先于全城陷落之前逃离，林谋盛便担当起了华人社团的总领袖。1942年2月11日这天，英军已做好弃城的准备，华人义勇军却迎着撤退的队伍而上，街上只见军人和逃难的市民交织在一起，乱作一团。林谋盛开着一辆吉普到英军的指挥部参加杰弗森准将主持的会议，这是他最后一次参加这种会议。出席这次会议的另一个华人代表是林忠邦。这次会议没有讨论任何问题，杰弗森准将发出了这样的训令，要将城内所有新闻报馆的印刷机器加以摧毁，指示林谋盛拟具应当摧毁的报馆名单。

会议上林忠邦提出了现在英国侨民眷属已全部撤离，华人侨领的家眷何时可以撤退的问题。杰弗森准将答应将在上午九点的参谋部会议上磋商。到了上午十点钟，英方打来电话通知，说华人侨领和家眷可以立即离开新加坡，并已由政治部主任陶林烈安排撤离路线。

当日日军飞机正大举轰炸市区。林谋盛准备马上回家收拾行李，但发现市区宝笼岗律和麦波申律的交通已被封锁。到下午一点，陶林烈通知说坐飞机撤退已经不可能，有一只可容纳五十人的船只要前往印度，可座位已经不多，不得搭乘家眷。林谋盛知道他已经没有办法带妻儿一起逃难了，因为已没有安全的交通工具。但是他的妻子珠娘却心情镇定地接受了现实，劝林谋盛以大局为重，赶紧独自安排撤离的事。别无他法，林谋盛只得将妻儿交给自己的弟弟林谋炎照顾，留足了生活费用。告别时分他心情十分沉重，为不能带她们一起撤离敌占区而心怀惭愧。儿女尚小，对于未来茫然无知，他们依次和林谋盛吻别。林谋盛劝妻子在他走了之后最好到乡下地区居住，妻子珠娘却认为最好还是重返自己的家去住，林谋盛只能祈求上帝保佑看顾她们。

当日下午，林谋盛和庄惠泉等人来到了惠罗公司附近的小码头，他已托人搞到两条摩托舢板船，准备当晚就落船出发。他们从水上警察局搞到了所需要的汽油，还有食品饮水等维生用品。本来当天晚上即可开船，但林谋盛很希望老朋友陶林烈能一起乘船逃亡，但陶林烈却还在指挥着城内的疏散，不能脱身。林谋盛于是决定等到次日早上六点，待陶林烈安排了公事之后能一起离去，于是当晚他们就睡在舢板船上。这是一个不眠之夜，只听得炮声连续不断。从炮声的方向判断，战斗是在武吉知马一带进行，表明华人义勇军还在浴血奋战。晚上有个叫卓祺嘉的非官吏议员前来向林谋盛索要一张疏散证，并说自己很对得起英国政府了，因为他是从北方的森美兰一路后退到新加坡，没有放弃议员职责。说毕他匆匆而去，准备带家人找船逃难。随后，有一个叫林建邦的人来见林谋盛，请求能将妻子黄素云带着逃离，而林建邦自己却不知何故要留在新加坡。当林建邦和林谋盛告别时，含有托妻的神情，依依不舍良久离去。当时庄惠泉对黄素云来搭船同行深不以为然，因为此次为逃难而非旅游，前途生死未卜，加上全船都是男性，多一女流十分不便。再说他自己和林谋盛等人均留下家眷在危城，却带着他人的太太逃难。林谋盛对于庄惠泉的责难沉默不语，稍后才对庄惠泉解释，时势紧迫大家只能通融点了。后来他们知道，先前那个来索取疏散证的卓祺嘉在红灯码头准备搭大火轮撤退时，惨遭敌机轰炸而死，死时手里还抱着一个孩子。而那个托妻的林建邦自妻子离去之后，日夜思念妻子，不久也抑郁而死，夫妻两人在惠罗码头的最后一面竟成永诀。

第二天早上六点，陶林烈和几个同僚如约而来，但他说自己现在还不能离开新加坡。于是林谋盛决定留下一条摩托舢板给陶林烈备用，自己和十六个人立即开船出逃。

这天的天气晴朗，阳光普照，他们船后面的新加坡一片浓烟弥漫。在前方，三务岛及毛广岛方面可以看到两柱黑烟直冲云霄，当局已开始破坏石油设施。抵达三务岛之前，舢板的摩托坏了。当船员在忙于修理之时，突然有三架日本飞机从毛广岛朝着他们的方向飞来，朝海里几只火轮投弹袭击。他们的舢板因为很小，免于遭轰炸而平安脱险。后来他们庆幸好在没有坐大火轮，否则已葬身大海了。

当日下午三点左右，摩托舢板到达了毛洛（Moroe）岛，遇见好些由新加坡撤出的人，其中有林谋盛的八哥、十四弟、十九弟。在这里，他们转搭上了和丰轮船公司的“丰川”号货轮。这条船上的马来籍船员都跑掉了，因此船长要他们在船上兼着干添煤烧锅炉、洗刷、做饭、守望等工作。林谋盛立即接受了任务，因为他想做些具体事情获得船上的英国军官兀菲罗上校的好印象，毕竟现在是寄人篱下。

这趟航行持续多天。两天之后是农历年三十，早上的时候他们的轮船驶抵印地亚真河口，看见两艘铁壳驳船和一艘小型汽船，用树枝和树叶伪装掩饰。他们发出信号却没有得到答复，对方可能怀疑他们是日军登陆部队。于是货轮沿着海岸继续向前。林谋盛等人轮流担任机房的添煤、煮饭，及守望飞来的飞机。庄惠泉在船上找到马来船员留下的四只鸡，做了一大锅香喷喷的鸡粥，供大家共度除夕。第二天是大年初一，他们到达了占碑岛，获知了英国军队总指挥官已向日本人投降。他们听到岛上爆炸的声音，引路的当地华人侨长解释说：苏门答腊的荷兰当局正在实行“焦土政策”迎接日军，焚烧了所有树胶存货和工厂设备。他们一路看到数股浓烟冲天，弥漫在占碑市镇上空。大年初一，他们一路所见的是这样一幅凄凉情景。

经过辗转反侧的难眠一夜，林谋盛这天很早起床，前往码头去寻找到巴东的船只。他看见两艘汽船停泊在海关码头边。一位马来人船员说：若干英国军人昨晚乘搭此船来到占碑。林谋盛决定去寻找那些军人，却不见他们踪影。市区内，所有商店仍停止营业。他们来到警察总局，看见数位英国军官在那里。林谋盛决定碰碰运气，过去自我介绍并提出要求。经过盘问之后，英国军官知道了林谋盛的名人身份，同意带他们一班人去巴东。他们深感高兴，连忙收拾行李上了船。下午六点时分，他们乘坐“海伦娜”号汽船离开占碑。

二月十八日晚七时，汽船停歇在甘榜，在那里他们获悉当地土著曾劫掠若干华人商店，双方都有死伤。在苏门答腊每个地方，华人非常担忧在荷兰当局撤退之后，当地土著将大肆抢掠他们。苏门答腊的土著占人口多数，尤其是在小市镇及甘榜地区。这天晚餐后，他们出外到当地侨长卓先生家里去听无线电广播。后来，有武装警察闻讯来调查他们的身份。他们被带到了当地统制官的办事处，见到了丹林那先生，他是白俄人，隶属于新加坡新闻部。在他的证明下，武装警察查清了他们的身份，同时答应提供一辆巴士车，载他们去目的地巴东。