在《论语·子路》中有这样的话：子曰：“南人有言曰：‘人而无恒，不可以作巫医。’善夫！‘不恒其德，或承之羞。’”
　　
　　这里记载的是孔子所发的一段议论。孔子说：“南方人有句话说：‘人要是没有恒心，连巫医也不能做的。’这句话说得好啊！‘人要是不能持久地保持德行，就会招来耻辱。’”（此语出自《周易》爻辞）
　　
　　对于孔子的这段议论，我们要指出两点：第一、孔子强调的重心是持之以恒的德行；第二、孔子认为巫、医两者有某种相通的共性，而且对其颇不以为然。在这里要说的是，现今很多人关注的却恰好是后者，因为这其中蕴涵着医术起源的重要信息。
　　
　　事实上，中国传统医学的历史也是很悠久的，其起源甚至可以追溯到远古传说时代。从字面上看，“医（醫）”字其下从“酉”，而“酉”字本是盛酒之器的象形，并且可以与“酒”通用。那么，“酒”与“醫”之前又有什么关系呢？原来，酒是最早的一种药。比如，古医书《黄帝内经》论及酒的作用时说：“邪气时至，服之万全”，后世也有“酒为百药之长”之说，可见酒在古代医药中的重要地位。
　　
　　不过，有的人会问，酒作为药的重要性又来自何处呢？这就涉及到了酒的更古老功用了，即联通人神之间的通道。酒本来可以加速血液循环、刺激大脑神经兴奋，使人有腾云驾雾、飘飘欲仙之感，但早期的人们不知其所以然，就把这种作用神秘化了，认为这是神灵使然，或者认为是与神灵交通的结果。因此，在原始巫术和宗教里，酒就被当作一种与神灵交流的重要中介，甲骨文和金文中都有这样的记载。而在古人看来，通神之物本身也有神性和神力，可以医治疾病，所以“醫”从“酉（酒）”。又由于通神之术和医药之术主要是由巫师来掌管，因此“医”在古代又写作是“醫”。由此可见，巫医原本同出一源，或者说，医本出于巫，医术其实是从巫术中分化而来的。巫、医的这段渊源，注定了医术在后世与数术之间的难解难分的复杂关系。
　　
　　随着社会的进步和人类理性的发展，巫的地位也逐渐下降了。在“绝地天通”之后，巫的地位为职官所取代，医药等方技之术也转而为职官所掌握。比如，《周礼·天官·冢宰》中就列有医师以及食医、疾医、疡医、兽医等专职官员，表明在三代时期医术已经开始从巫术当中逐渐独立出来了。当然，巫的活动并未完全消失，此前巫医合一的文化风貌也还是留下了蛛丝马迹的，像《山海经·海内西经》中说六巫“皆操不死之药”，《大荒西经》也有十巫升降于“百药爰在”的灵山之说，其中巫咸、巫彭在《世本》、《吕氏春秋》等古籍中又明确被称为“医”，其名在甲骨文的卜辞中也屡屡出现，可见其活动年代大致不出殷商时期。
　　
　　西周以后，礼崩乐坏，职官分化，医术也开始流向民间，师徒传承，逐渐形成了一种职业。与此同时，医家也开始注意总兴奋剂自己以及前人的医疗实践经验，使得医药之术逐渐系统化、理论化。《七略》著录西汉以前的书籍，其中“方技略”下共收“医经”、“经方”、“房中”、“神仙”四类之书：前两类是系统的医学理论和药剂学、药物学著作；“房中”书主要与性学、优生学有关：“神仙”书则与饮食以及后世的体操、气功等养生健体方法有关。这里，我们从“神仙”之名、书的内容以及这种分类方法本身来看，仍然可以略窥上古以来巫医不分的神秘主义气息。